Zajedno su se borili protiv perzijskog neprijatelja za vrijeme produljenih perzijskih ratova, ali nakon toga odnosi su se još više zaoštrili. Grčki protiv Grka, Peloponeški rat je nosio obje strane dovodeći do stanja u kojem su vođa Makedonije i njegovi sinovi Filip i Aleksandar mogli preuzeti kontrolu.
Peloponeški rat vodio se između dvije skupine grčkih saveznika. Jedan je bio Peloponeška liga, koji je Sparta imao kao vođu. Drugi je vođa bila Atena koja je kontrolirala Delian liga.
Prije Peloponeskog rata (Svi datumi u 5. stoljeću prije Krista)
| 477 | Aristides formira Delian League. |
| 451 | Atena i Sparta potpisuju petogodišnji ugovor. |
| 449 | Perzija i Atena potpisuju mirovni ugovor. |
| 446 | Atena i Sparta potpisuju 30-godišnji mirovni ugovor. |
| 432 | Pobuna Potidaea. |
1. stadij Peloponeskog rata (Arhidamanski rat) Od 431-421
Atena (pod Periklo a zatim Nicias) uspješan do 424. godine. Atena morskim pješacima na Peloponezu pravi more, a Sparta uništava područja u selu Atika. Atena čini katastrofalnu ekspediciju u Boeotiju. Pokušavaju oporaviti Amfipolis (422), bezuspješno. Atena se boji da će više njenih saveznika napustiti, pa potpisuje ugovor (Mir Nicias) koji joj omogućuje da zadrži njezino lice, u osnovi vraćajući stvari onakvima kakve su bile prije rata, osim Plateje i trakijskih gradova.
| 431 | Počinje Peloponeški rat. Opsada Potidaea. Kuga u Ateni. |
| 429 | Pericles umire. Opsada Plataje (-427) |
| 428 | Pobuna Mitylene. |
| 427 | Atenska ekspedicija na Siciliju. [Pogledajte kartu Sicilije i Sardinije.] |
| 421 | Mir Nicias. |
2. faza Peloponeskog rata 421-413
Korint formira koalicije protiv Atene. Alcibijada stvara nevolje i protjeran je. Izdaje Atenu do Sparte. Obje strane traže savezništvo s Argosom, ali nakon bitke na Mantineji, gdje Argos gubi većinu svoje vojske, Argos više nije važan, iako postaje saveznica Atenija.
415-413. - Atenska ekspedicija u Sirakuzu. Sicilija.
3. faza Peloponeskog rata 413.-40. (Deleanski ili Jonski rat)
Prema savjetu Alcibijade, Sparta napada invaziju na Atiku, zauzimajući grad Decelea u blizini Atene [izvor: Jona Lendering]. Atena i dalje šalje brodove i ljude na Siciliju iako je to katastrofalno. Atena, koja je započela rat s prednosti u pomorskoj bitki, gubi svoju prednost Korinćanima i Sirakuzanima. Sparta je zatim upotrijebila perzijsko zlato iz Cyrusa za izgradnju svoje flote, stvara probleme s atenskim saveznicima u Ioniji i uništava atensku flotu u bitci kod Aegosotamija. Spartance vodi Lysander.
404 - Atena se predaje.
Peloponeski rat završava
Atena gubi demokratsku vladu. Kontrola se postavlja u Odbor od 30. Saveznici Sparte moraju plaćati 1000 talenata godišnje. Trideset tirana vladali su Atinom.