Iako je E. opća populacija coli je poznata po zaraznoj prirodi jednog određenog soja (O157: H7), malo je ljudi svjesno kako svestran i široko korišten, u istraživanjima je uobičajeni domaćin za rekombinantnu DNK (nove genetske kombinacije različitih vrsta ili izvori).
Bakterije čine korisna sredstva za genetička istraživanja zbog njihove relativno male veličine genoma u usporedbi s eukariotima (ima organele povezane s jezgrom i membranom). E. ćelije coli imaju samo oko 4,400 gena, dok je projektom ljudskog genoma utvrđeno da ljudi sadrže oko 30 000 gena.
Također, bakterije (uključujući E. coli) cijeli život žive u haploidnom stanju (imaju jedan skup neparnih kromosoma). Kao rezultat, ne postoji drugi skup kromosoma koji bi prikrio učinke mutacija tijekom proteinski inženjering eksperimenti.
To omogućava pripremu log-faze (logaritamske faze, ili razdoblja u kojem populacija raste eksponencijalno) kulture preko noći sa srednjim putem do maksimalne gustoće.
Genetski eksperimentalni rezultati u samo nekoliko sati umjesto nekoliko dana, mjeseci ili godina. Brži rast znači i bolje stope proizvodnje kada se kulture upotrebljavaju u proširenju
fermentacija procesi.E. coli se prirodno nalazi u crijevnim traktima ljudi i životinja gdje pomaže osigurati hranjive tvari (vitamine K i B12) svom domaćinu. Postoji mnogo različitih sojeva E. coli koji mogu stvarati toksine ili uzrokovati različite razine infekcije ako se gutaju ili im se dozvoli da napadnu druge dijelove tijela.
Unatoč lošoj reputaciji jednog posebno toksičnog soja (O157: H7), E. Sojevi coli relativno su neškodljivi kada se postupa uz razumnu higijenu.
E. genom coli bio je prvi koji je potpuno sekvenciran (1997.). Kao rezultat toga, E. coli je mikro proučavajući mikroorganizam. Napredno poznavanje njegovih mehanizama ekspresije proteina olakšava upotrebu eksperimenata gdje ekspresija stranih proteina i odabir rekombinanta (različite kombinacije genetskog materijala) bitno.
Većina tehnika gena za kloniranje razvijena je pomoću ove bakterije i još su uspješnija ili učinkovitija u E. coli nego u ostalim mikroorganizmima. Kao rezultat, priprema kompetentnih stanica (stanica koje će preuzeti stranu DNK) nije komplicirana. Transformacije s drugim mikroorganizmima često su manje uspješne.
Budući da tako dobro raste u ljudskom crijevu, E. coli je lako uzgajati tamo gdje ljudi mogu raditi. Najugodnije je na tjelesnoj temperaturi.
Iako je 98,6 stupnjeva većini ljudi malo toplo, lako je održavati tu temperaturu u laboratoriju. E. coli živi u ljudskom crijevu i rado konzumira bilo koju vrstu predigrirane hrane. Također može rasti i aerobno i anaerobno.
Dakle, može se umnožiti u crijevima čovjeka ili životinje, ali jednako je sretan u petrijevoj posudi ili tikvici.
E. Coli je nevjerojatno svestran alat za genetske inženjere; Kao rezultat toga, ona je bila od velike važnosti u proizvodnji nevjerojatnog spektra lijekova i tehnologija. Prema Popular Mechanics, čak je postao i prvi prototip bio-računala: "U modificiranom E. coli 'transkriptor', koji su istraživači sa Sveučilišta Stanford razvili u ožujku 2007., niz DNK predstavlja žicu i enzime za elektrone. Potencijalno, ovo je korak prema izgradnji radnih računala unutar živih stanica koje bi se mogle programirati za kontrolu ekspresije gena u organizmu. "
Takav se podvig mogao postići samo upotrebom dobro razumljivog organizma, s njim je lako raditi i moći se brzo ponoviti.