Jedan od najhitnijih izazova s kojima su se afričke države suočile protiv neovisnosti bio je njihov nedostatak infrastrukture. Europski imperijalisti ponosili su se time što su doveli civilizaciju i razvijali Afriku, ali ostavili su svoje bivše kolonije malo na putu do infrastrukture. Carstva su gradila ceste i željeznice - ili bolje rečeno, prisiljavala ih je kolonijalne podanike da ih grade - ali oni nisu bili namijenjeni izgradnji državne infrastrukture. Carske ceste i željeznice gotovo su uvijek bile namijenjene olakšavanju izvoza sirovina. Mnogi su, poput željeznice Ugande, trčali ravno prema obali.
Ovim novim zemljama također je nedostajala proizvodna infrastruktura koja bi dodala vrijednost svojim sirovinama. Bogati koliko su afričke zemlje bile u gotovinskim kulturama i mineralima, same nisu mogle prerađivati tu robu. Njihova su gospodarstva bila ovisna o trgovini, a to ih je učinilo ranjivima. Oni su također bili zaključani u krugove ovisnosti o svojim bivšim europskim gospodarima. Stekli su političku, a ne ekonomsku ovisnost, i kao Kwame Nkrumah - prvi premijer ministar i predsjednik Gane - znao je da je politička neovisnost bez ekonomske neovisnosti besmisleno.
Ovisnost o energiji
Nedostatak infrastrukture također je značio da su afričke zemlje veći dio svoje energije ovisile o zapadnim ekonomijama. Ni zemlje bogate naftom nisu imale rafinerije potrebne za pretvorbu svoje sirove nafte u benzin ili lož ulje. Neki su vođe, poput Kwame Nkrumah, pokušali to ispraviti poduzimajući masivne građevne projekte, poput projekta hidroelektrane rijeke Volta. Brana je dala prijeko potrebnu struju, ali njezina je izgradnja Ganu snažno zadužila. Izgradnja je također zahtijevala izmještanje desetaka tisuća Ganaca i pridonijelo je snažnoj podršci Nkrumaha u Gani. 1966. bio je Nkrumah srušeno.
Neiskusno vodstvo
U Neovisnosti je bilo nekoliko predsjednika Jomo Kenyatta, imao je nekoliko desetljeća političkog iskustva, ali drugi, poput Tanzanije Julius Nyerere, ušao je u politički sukob samo nekoliko godina prije osamostaljenja. Zapažen je i nedostatak obučenog i iskusnog civilnog vodstva. Donji slojevi kolonijalne vlade dugo su bili zaposleni afrički podanici, ali viši činovi bili su rezervirani za bijele dužnosnike. Prelazak na državne časnike u neovisnost značio je da postoje pojedinci na svim razinama birokracije s malo prethodne obuke. U nekim je slučajevima to vodilo inovacijama, ali mnogi su izazovi s kojima su se afričke države suočile s neovisnošću često bile usložnjene nedostatkom iskusnog vodstva.
Nedostatak nacionalnog identiteta
Granice koje su ostale nove afričke države bile su one koje su crtane u Europi tijekom Pokušajte u Africi bez obzira na etnički ili društveni krajolik na terenu. Subjekti ovih kolonija često su imali mnogo identiteta koji su nadmetali njihov osjećaj da su, na primjer, Gana ili Kongo. Kolonijalna politika koja je privilegirala jednu skupinu nad drugom ili dodijeljivala zemljišna i politička prava od strane „plemena“ pogoršala je te podjele. Najpoznatiji slučaj toga bile su belgijske politike koje su kristalizirale podjele između Hutusa i Tutsisa u Ruandi što je dovelo do tragičnog genocida 1994. godine.
Odmah nakon dekolonizacije, nove afričke države složile su se politike nepovredivih granica, što znači da neće pokušati preoblikovati afričku političku kartu jer bi to dovelo do kaosa. Čelnici ovih zemalja bili su, prema tome, izazovi pokušaja oblikovanja osjećaja nacionalnog identiteta u vrijeme kada su oni koji traže udjele u novoj zemlji često igrali na regionalne ili etničke pojedince lojalnost.
Hladni rat
Konačno, dekolonizacija se poklopila s hladnim ratom, koji je predstavljao još jedan izazov za afričke države. Gura i povlačenje između Sjedinjenih Država i Unije sovjetskih socijalističkih republika (SSSR) učinili su nesvrstavanje a teška, ako ne i nemoguća opcija, a oni čelnici koji su pokušali urezati treći put općenito su ustanovili da moraju poduzeti strane.
Politika hladnog rata također je ukazala priliku za frakcije koje su pokušavale izazivati nove vlade. U Angoli je međunarodna potpora koju su vlade i pobunjeničke frakcije dobile u hladnom ratu dovela do građanskog rata koji je trajao gotovo trideset godina.
Ovi kombinirani izazovi otežavali su uspostavljanje snažnih gospodarstava ili političke stabilnosti u Afrika i pridonijeli preokretu s kojim su se suočile mnoge države (ali ne sve!) Između kasnih 60-ih i kasnih 90-ih.