Uz tehnologiju koja je danas dostupna znanstvenicima, postoji mnogo načina da se teorija evolucije potkrijepi dokazima. Sličnosti DNK između vrsta, znanje o razvojna biologijai drugih dokaza za mikroevoluciju ima u izobilju, ali znanstvenici nisu uvijek imali sposobnost ispitivanja ove vrste dokaza. Pa kako su podržavali evolucijsku teoriju prije ovih otkrića?
Znanstvenici su podržali glavni put Teorija evolucije kroz povijest je pomoću anatomske sličnosti između organizama. Prikazivanje kako dijelovi tijela jedne vrste nalikuju dijelovima tijela druge vrste, kao i nakupljanje prilagodbi sve dok strukture ne postanu slične na nepovezanim vrstama, neki su načini evolucije potkrijepljeni anatomskim dokazima. Naravno, uvijek se nađu tragovi davno izumrlih organizama koji također mogu dati dobru sliku o tome kako se vrsta mijenjala tijekom vremena.
Tragovi života iz prošlosti nazivaju se fosili. Kako fosili pružaju dokaze u prilog teoriji evolucije? Kosti, zubi, školjke, otisci ili čak u potpunosti sačuvani organizmi mogu naslikati kakav je život bio u vremenskim periodima od davnih vremena. Ne samo da nam daje tragove organizmima koji su dugo izumrli, već također može pokazati intermedijarne oblike vrsta dok su podvrgnuti specifikaciji.
Znanstvenici mogu koristiti informacije s fosila da bi postavili intermedijarne forme na pravo mjesto. Oni se mogu koristiti relativnim datiranjem i radiometrijskim ili apsolutnim datiranjem kako bi otkrili starost fosila. Ovo može pomoći u popunjavanju nedostataka u znanju kako se vrsta mijenjala iz jednog vremenskog razdoblja u drugo tijekom razdobljaGeološka vremenska skala.
Iako neki protivnici evolucije kažu da je zapis o fosilima zapravo dokaz evolucije jer u zapisu o fosilima postoje "nestale veze", to ne znači da je evolucija neistinita. Fosile je vrlo teško stvoriti i okolnosti moraju biti upravo takve kako bi mrtvi ili raspadajući organizam postao fosil. Najvjerojatnije postoji i mnogo neotkrivenih fosila koji bi mogli popuniti neke praznine.
Ako je cilj utvrditi koliko su dvije vrste povezane s filogenetskim stablom života, tada je potrebno ispitati homologne strukture. Kao što je već spomenuto, morski psi i dupini nisu usko povezani. Međutim, delfini i ljudi jesu. Jedan dokaz koji podupire ideju da delfini i ljudi potječu od zajedničkog pretka jesu njihovi udovi.
Delfini imaju prednje peraje koje pomažu u smanjenju trenja u vodi dok plivaju. Međutim, gledajući kosti unutar peraja, lako je vidjeti koliko je građevina slična ljudskoj ruci. To je jedan od načina na koji znanstvenici klasificiraju organizme u filogenetske skupine koje se odvajaju od zajedničkog pretka.
Iako dupin i morski pas izgledaju vrlo slično obliku tijela, veličini, boji i položaju peraja, oni nisu usko povezani s filogenetskim stablom života. Delfini su zapravo mnogo bliže čovjeku nego morski psi. Pa zašto oni izgledaju toliko slično ako nisu u vezi?
Odgovor leži u evoluciji. Vrste se prilagođavaju svom okruženju kako bi ispunile prazno nišu. Budući da morski psi i dupini žive u vodi u sličnim klimama i područjima, imaju slično niša koje treba popuniti nečim u tom području. Nepovezane vrste koje žive u sličnom okruženju i imaju istu vrstu odgovornosti u svojim ekosustavima i imaju tendenciju da akumuliraju prilagodbe koje se dodaju tako da čine da liče jedna na drugu.
Ove vrste analognih struktura ne dokazuju da su vrste povezane, već ih podržavaju Teorija evolucije pokazuje kako vrste grade prilagodbe kako bi se uklopile u svoje okruženja. To je pokretačka snaga specifikacije ili promjene vrste tijekom vremena. To je, po definiciji, biološka evolucija.
Neki dijelovi u tijelu ili na tijelu više nemaju vidljivu upotrebu. Riječ je o ostacima iz prethodnog oblika vrste prije pojave specifikacije. Čini se da je vrsta nagomilala nekoliko prilagodbi zbog kojih dodatni dio više nije bio koristan. S vremenom je dio prestao funkcionirati, ali nije u potpunosti nestao.
Više korisni dijelovi nazivaju se vestigijalne strukture i ljudi ih imaju nekoliko, uključujući i kralježnicu koja nema rep povezan s njim i organ zvan dodatak koji nema prividnu funkciju i može biti uklonjena. U nekom trenutku tijekom evolucije, ovi dijelovi tijela više nisu bili potrebni za opstanak i oni su nestali ili prestali funkcionirati. Vestigijalne strukture su poput fosila unutar organizma koji daju tragove prošlim oblicima vrste.