Aminokiseline su vrsta organske kiseline koja sadrži i karboksilnu skupinu (COOH) i amino skupinu (NH2). Opća formula za aminokiseline je dana u nastavku. Iako se obično piše o neutralno nabijenoj strukturi, netočna je jer je kiseli COOH i bazični NH2 skupine međusobno reagiraju, stvarajući unutarnju sol zvanu zwitterion. Zwitterion nema neto naboj; postoji jedan negativan (COO-) i jedan pozitivan (NH3+) naboj.
Iz njega potječe 20 aminokiselina proteini. Iako postoji nekoliko metoda njihova kategoriziranja, jedna od najčešćih je grupiranje u skladu s prirodom njihovih bočnih lanaca.
Ima ih osam aminokiseline s nepolarnim bočnim lancima. Glicin, alanin i prolin imaju male nepolarne bočne lance i svi su slabo hidrofobni. Fenilalanin, valin, leucin, izoleucin i metionin imaju veće bočne lance i jače su hidrofobni.
Postoji i osam aminokiselina s polarnim, neispunjenim bočnim lancima. Serin i treonin imaju hidroksilne skupine. Asparagin i glutamin imaju amidne skupine. Histidin i triptofan imaju heterocikličke bočne lance aromatskog amina. Cistein ima sulfhidrilnu skupinu. Tirozin ima fenolni bočni lanac. Sulfhidrilna skupina cisteina, fenolna hidroksilna skupina tirozina i imidazolna skupina histidina pokazuju određeni stupanj ionizacije koji ovisi o pH.
Postoje četiri aminokiseline s nabijenim bočnim lancima. Aspartanska kiselina i glutaminska kiselina imaju karboksilne skupine na svojim bočnim lancima. Svaka kiselina je u potpunosti ionizirana pri pH 7,4. Arginin i lizin imaju bočne lance s amino skupinama. Njihovi bočni lanci u potpunosti se protoniraju pri pH 7,4.