Nisu sve valne duljine svjetlosti apsorbirane tijekom fotosinteze. Zelena, boja većine biljaka, zapravo je boja koja se odražava. Svjetlost koja se apsorbira dijeli vodu na vodik i kisik:
Mračne reakcije ne zahtijevaju svjetlost, ali ni to ih ne inhibira. Za većinu biljaka tamne reakcije odvijaju se tijekom dana. Tamna reakcija događa se u stromi kloroplasta. Ta se reakcija naziva fiksiranje ugljikom ili Calvin ciklus. U ovoj reakciji, ugljični dioksid se pretvara u šećer koristeći ATP i NADPH. Ugljični dioksid kombinira se s 5-ugljikovim šećerom kako bi nastao 6-ugljični šećer. Šećer sa 6 ugljika razbijen je na dvije molekule šećera, glukozu i fruktozu, koje se mogu koristiti za izradu saharoze. Za reakciju je potrebno 72 fotona svjetlosti.
Učinkovitost fotosinteze ograničena je čimbenicima okoliša, uključujući svjetlost, vodu i ugljični dioksid. U vrućem ili suhom vremenu, biljke mogu zatvoriti svoje stomake radi očuvanja vode. Kad se stomaci zatvore, biljke mogu započeti fotorespiranu. Biljke zvane C4 biljke održavaju visoku razinu ugljičnog dioksida u stanicama koje stvaraju glukozu kako bi se izbjeglo fotorespiranje. C4 biljke proizvode ugljikohidrate učinkovitije od uobičajenih biljaka C3, pod uvjetom da ugljični dioksid ograničava i ima dovoljno svjetla za podupiranje reakcije. U umjerenim temperaturama biljke se prekomjerno opterećuju kako bi strategija C4 bila isplativa (nazvana 3 i 4 zbog broja ugljika u intermedijarnoj reakciji). C4 biljke uspijevaju u vrućim i suhim klimama. Studijska pitanja
Evo nekoliko pitanja koja si možete postaviti kako biste vam pomogli utvrditi da li stvarno razumijete osnove funkcioniranja fotosinteze.