Mongolija je visok, hladan i suh. Ima ekstremno kontinentalnu klimu s dugim, hladnim zimama i kratkim ljetima, tijekom kojih pada većina oborina. Zemlja prosječno godišnje ima 257 oblaka i obično je u središtu područja visokog atmosferskog tlaka. Količina oborina najviša je na sjeveru, koje prosječno iznosi 20 do 35 centimetara godišnje, a najmanje na jugu, koje prima 10 do 20 centimetara (vidi sl. 5). Krajnji jug je Gobi, od kojih neke regije većinu godina uopće ne padaju. Ime Gobi je mongolski što znači pustinja, depresija, slani močvara ili stepa, ali što se obično odnosi na kategorija sušnih nizina s nedovoljnom vegetacijom za podupiranje marmota, ali s dovoljno za podupiranje deva. Mongoli razlikovati gobija od pravog pustinje, iako razlika nije uvijek očita strancima koji nisu upoznati s mongolskim krajolikom. Raspon područja Gobija krhki su i lako ih se uništava prekomjernom ispašom, što rezultira širenjem prave pustinje, kamenitog otpada na kojem ne mogu preživjeti ni baktričke deve.
Prosječne temperature u većem dijelu zemlje ispod ledišta su od studenog do ožujka, a približno u travnju i listopadu. Prosjek siječnja i veljače od -20 ° C uobičajen je, a zimske noći od -40 ° C javljaju se većinom godina. Ljetni ekstremi dosežu čak 38 ° C u južnoj regiji Gobi i 33 ° C u Ulaanbaataru. Više od polovice zemlje prekriveno je permafrostom, što otežava gradnju, izgradnju cesta i rudarstvo. Zimi se smrzavaju sve rijeke i slatkovodna jezera, a manji potoci obično se smrzavaju na dnu. Ulaanbaatar leži na 1.351 metru nadmorske visine u dolini rijeke Tuul Gol. Smješten na relativno dobro zalivanom sjeveru, prosječno godišnje prima 31 centimetar taloženje, a gotovo sve pada u srpnju i kolovozu. Ulaanbaatar ima prosječnu godišnju temperaturu od -2,9 ° C i razdoblje bez smrzavanja koje se prosječno protežu od sredine lipnja do kraja kolovoza.
Vrijeme za Mongoliju karakterizira ekstremna varijabilnost i kratkotrajna nepredvidivost ljeti, a višegodišnji prosjeci kriju velike razlike u količinama oborina, datumima mrazi pojave oluja i proljetne olujne oluje. Takvo vrijeme predstavlja ozbiljne izazove opstanku ljudi i stoke. Službena statistika navodi manje od 1 posto zemlje kao obradive zemlje, 8 do 10 posto kao šume, a ostatak kao pašnjak ili pustinja. Žito, uglavnom pšenica, uzgaja se u dolinama sustava rijeke Selenge na sjeveru, ali donosi prinose fluktuiraju široko i nepredvidivo kao rezultat količine i vremena kiše i datuma ubijajući mrazeve. Iako su zime uglavnom hladne i bistre, povremene su snježne oluje koji ne talože puno snijega, ali pokrivaju travu dovoljno snijega i leda da ispaša paša bude nemoguća, čime se ubijaju deseci tisuća ovaca ili goveda. Takvi gubici stoke, koji su neizbježna i, u izvjesnom smislu, normalna posljedica klime, otežavali su planirano povećanje stočnog broja.