Pročišćavanje balastne vode najnovijom tehnologijom može zadovoljiti standarde pri brzini od 2500 kubičnih metara (660.430 galona u satu) na sat. Velikom plovilu još uvijek može trebati nekoliko sati po razmjeni da isprati svoje balastne spremnike ovom brzinom.
Prva, razmjena balastne vode, temelji se na određenim udaljenostima i dubinama na kojima se plovilo može iskrcati.
Neka područja uvode standarde koji prelaze smjernice IMO-a. I Kalifornija i područje Velikih jezera u Sjedinjenim Državama usvojili su stroge lokalne smjernice. SAD je jedna od mnogih glavnih brodskih država koje nisu potpisale konvenciju.
U slučaju razmjene balastne vode, brodski operateri istiskuju neobrađeni balast iz spremnika. Ovo je praktičan, ako ne i savršen način za omogućavanje rada starijih plovila bez troška i logističkih problema retrofitinga za obradu balastne vode.
Nova i preuređena plovila imaju manje vjerojatnosti da će prevoziti neželjene vrste zbog balastne vode sustavi za obradu prije uklanjaju veliki dio održivih organizama iz balastnih spremnika pražnjenje.
Voda obrađena prema ovom standardu smatra se dovoljno čistom da se može ispustiti u većini luka. Ovi koraci za ponovno posredovanje balastne vode učinkoviti su samo u uklanjanju neželjenih organizama. Još uvijek je moguće prenijeti toksine poput bakra i teških metala koji se često nalaze u lukama do drugih odredišta u balastnoj vodi i ti se onečišćujući tvari mogu koncentrirati u sedimentu balastnih spremnika. Radioaktivne tvari mogu se transportirati i u balastnom stanju, ali svi ozbiljni slučajevi će vjerojatno brzo pronaći osoblje za nadzor.