siRNA, što označava malu interferirajuću ribonukleinsku kiselinu, je klasa dvolančanih RNA molekula. Ponekad je poznata i kao kratka interferirajuća RNA ili prigušivajuća RNA.
Mali interferirajući RNA (siRNA) mali su komadi dvolančane (ds) RNA, obično dugačke oko 21 nukleotida, s 3 '(izraženim tropredmetnim) nadvratnicima (dva nukleotide) na svakom kraju koji se mogu upotrijebiti za "miješanje" u translaciju proteina vezanjem i promicanjem razgradnje mesna RNA (mRNA) na specifičnu sekvenci.
Funkcija siRNA
Prije nego što se udubite u točno što je siRNA (ne treba se brkati) Mirna), važno je znati funkciju RNA. Ribonukleinska kiselina (RNA) je nukleinska kiselina prisutna u svima živih stanica i djeluje kao glasnik koji prenosi upute DNA za kontrolu sinteze proteini.
U virusima RNA i DNA mogu nositi informacije.
Pri tome, siRNA sprečavaju proizvodnju specifičnih proteina zasnovanih na nukleotidnim nizovima njihovih odgovarajućih mRNA. Proces se naziva RNA interferencija (RNAi), a može se nazvati i prigušivanjem siRNA ili srušavanjem siRNA.
Odakle dolaze
za siRNA se obično smatra da potječu iz dužih nizova egzogenog uzgoja ili potječu iz izvan organizma (RNA koju stanica preuzme i podvrgne daljnjoj obradi).
RNA često potječe vektoripoput virusa ili transpozona (gen koji može mijenjati položaje u genomu). Otkriveno je da oni igraju ulogu u antivirusnoj obrani, degradaciji pretjerano proizvedene mRNA ili mRNA za koju je prekinut prijevod ili sprječavanju poremećaja genomske DNK transpozonima.
Svaki siRNA lanac ima 5 '(pet glavnih) fosfatnu skupinu i 3' hidroksilnu (OH) skupinu. Proizvode se iz dnaRNK ili RNA izrezane ukosnice koja se nakon ulaska u stanicu odvaja pomoću enzima sličnog RNase III, koji se naziva Dicer, koristeći RNase ili restrikcijski enzimi.
SiRNA se zatim integrira u proteinski kompleks s više podjedinica nazvan RNAi-inducirani prigušivački kompleks (RISC). RISC "traži" odgovarajuću ciljanu mRNA, gdje se siRNA odmotava i, vjeruje se, antisense lanac usmjerava razgradnju komplementarne niti mRNA, koristeći kombinaciju endo- i egzonuklese enzimi.
Medicinske i terapijske uporabe
Kada se stanica sisavca suoči s dvolančanom RNA, poput siRNA, može to pogrešno donijeti kao virusni nus-produkt i pokrenuti imuni odgovor. Uz to, uvođenje siRNA može uzrokovati nenamjerno ciljanje, gdje mogu biti napadnuti i izbačeni i drugi ne prijeteći proteini.
Unošenje previše siRNA u tijelo može rezultirati nespecifičnim događajima zbog urođenog imunološkog odgovora aktivacije, ali s obzirom na sposobnost da se pobijede bilo koji zanimljivi gen, siRNA imaju potencijal za mnoge terapijske uporabe.
Mnoge bolesti mogu se liječiti inhibiranjem ekspresije gena, kemijskim modificiranjem siRNA kako bi se poboljšala njihova terapijska svojstva. Neka svojstva koja bi se mogla poboljšati su:
- Pojačana aktivnost
- Povećana stabilnost u serumu i manje izvan ciljeva
- Smanjena imunološka aktivacija
Stoga je dizajn sintetičke siRNA za terapijsku upotrebu postao popularan cilj mnogih biofarmaceutskih tvrtki.
Detaljna baza podataka o svim takvim kemijskim modifikacijama ručno se kurira na siRNAmod, ručno kurirana baza eksperimentalno potvrđenih kemijski modificiranih siRNA.